1. Teoría de Control y de Decisión ( 3 asignaturas),
2. Sistemas Complejos (3 asignaturas),
3. Teoría de la Computación (2 asignaturas),
4. Teoría de la Información (2 asignaturas),
5. Socio – Humanista (2 asignaturas),
6. Integradora (3 asignaturas).

Está dirigida, aunque no exclusivamente, a personas que han estudiado una Ingeniería en Cibernética, en Computación, en Electrónica, en Mecánica, en Mecatrónica, en Telecomunicaciones, en Química, una Licenciatura en Informática, en Física y en Matemáticas, o áreas afines a éstas. El enfoque de la maestría puede ser de investigación o de aplicación en alguna de las áreas de la cibernética.

El programa de maestría tiene como objetivo formar posgraduados a nivel maestría con los conocimientos, las habilidades y las actitudes necesarios para realizar, adaptar y gestionar proyectos de investigación o desarrollo tecnológico del área de la cibernética, en sistemas naturales y artificiales, aplicando las teorías de: sistemas complejos, decisión y control, computación e información; que contribuyan a elevar el desarrollo del país y su competitividad a nivel internacional, bajo un marco de valores éticos y de responsabilidad social.